To 2004 o Εργοτέλης έκανε μια απο τις μεγάλες εκλήξεις στην ιστορία του Ελληνικού ποδοσφαίρου. Κερδισε σε αγώνα μπαράζ στην Θεσσαλονίκη τον Ακράτητο, ομάδα τότε της Α’ Εθνικής και κατάφερε να ανέβει για πρώτη φορά στην ιστορία του στην μεγάλη κατηγορία. Το 2012, μια άλλη ομάδα της Κρήτης, ο Πλατανιάς Χανίων, έγινε η τρίτη ομάδα της Κρήτης, που μετά τον ΟΦΗ και τον Εργοτέλη, θα αγωνιστεί στα «σαλόνια».